POUR LES PATIENTS ET LEURS PROCHES · EXEMPLE

À quoi un rapport
pourrait ressembler.

Un exemple construit à partir d’un échantillon inventé et passé par le même calcul que le prototype. Rien ici n’est le résultat d’une personne réelle.

En développement · Étude pilote en préparation

Trois mots à connaître d’abord

Mesuré
La part d’un type de bactérie ou d’un processus génétique dans l’échantillon, en pourcentage de tout ce qui a été rapporté. Une part de tout ce qui a été rapporté.
Intervalle de référence
Là où se situait la plupart des personnes d’un groupe de comparaison issu d’une étude, ajusté selon l’âge, le sexe et l’indice de masse corporelle. Une comparaison qui donne son contexte à votre résultat.
Comparaison
Si la part mesurée se situait en dessous, à l’intérieur ou au-dessus de cet intervalle. Le point de départ de la conversation avec votre clinicien.
RAPPORT D’EXEMPLE · DONNÉES INVENTÉES
Échantillon
Profil complet illustratif
Contexte enregistré
Femme, 46 ans, IMC 24,5 (inventé)
Relu par
Clinicien d’exemple
Analyse
Modèle de référence figé, version 1
  • 48Dans l’intervalle
  • 5Au-dessus de l’intervalle
  • 1En dessous de l’intervalle

Résumé de votre clinicien

Les 54 mesures ont été comparées à l’intervalle de référence : 48 s’y trouvaient, 5 au-dessus et 1 en dessous. Chaque comparaison est un point de départ pour notre conversation. Voici les six dont j’aimerais parler avec vous, avec ce que la recherche montre pour chacune.

Résultats à discuter

Six comparaisons se situaient hors de l’intervalle. Pour chacune : la part mesurée, l’intervalle, et ce que cela nous dit.

Type de bactérie

Oscillibacter sp. KLE 1745

Au-dessus de l’intervalle
Mesuré1.21%
Intervalle de référence0.071% – 0.671%

Ce que cela signifie

Ce type particulier d’Oscillibacter représentait une part de l’échantillon plus grande que chez la plupart du groupe de comparaison.

Type de bactérie

Hungatella hathewayi

Au-dessus de l’intervalle
Mesuré0.478%
Intervalle de référence0.023% – 0.123%

Ce que cela signifie

Une part plus grande que chez la plupart du groupe de comparaison. Cette espèce apparaît dans des recherches sur l’alimentation et l’intestin menées dans d’autres groupes de personnes.

Type de bactérie

Akkermansia glycaniphila

Au-dessus de l’intervalle
Mesuré0.003%
Intervalle de référence0% – 0.000724%

Ce que cela signifie

Détectée à une très petite part, là où la plupart du groupe de comparaison n’en avait aucune détectée.

Type de bactérie

Butyricicoccus sp. K4410.MGS-46

Au-dessus de l’intervalle
Mesuré0.187%
Intervalle de référence0.0161% – 0.159%

Ce que cela signifie

Légèrement au-dessus de l’intervalle, près de sa limite supérieure.

Type de bactérie

Faecalibacterium prausnitzii

En dessous de l’intervalle
Mesuré0.0816%
Intervalle de référence0.163% – 1.64%

Ce que cela signifie

Une part plus petite que chez la plupart du groupe de comparaison. C’est une bactérie intestinale très étudiée, souvent évoquée avec le butyrate et le système immunitaire.

Type de bactérie

Roseburia intestinalis

Au-dessus de l’intervalle
Mesuré2.79%
Intervalle de référence0.123% – 2.32%

Ce que cela signifie

Une part plus grande que chez la plupart du groupe de comparaison. Cette espèce est étudiée pour sa production de butyrate, un acide gras à chaîne courte.

Prochaines étapes

Nous parlerons de ces six comparaisons lors de votre rendez-vous, et nous déciderons ensemble si l’une d’elles mérite un examen plus attentif.

Suivi

Un échantillon ultérieur pourrait être comparé à celui-ci pour voir ce qui a changé, sans présumer pourquoi.

Les 54 mesures

Chaque mesure que le rapport a comparée, regroupée par type. Les valeurs sont des parts de ce qui a été rapporté, arrondies.

Types de bactéries 47
MesureMesuréIntervalle de référenceComparaison
Atopobium sp. BV3Ac40%0% – 0.00024%Dans l’intervalle
Coriobacteriaceae bacterium BV3Ac10.000208%0% – 0.000994%Dans l’intervalle
Fusicatenibacter saccharivorans0.393%0.181% – 1.38%Dans l’intervalle
Oscillibacter sp. KLE 17451.21%0.071% – 0.671%Au-dessus de l’intervalle
Blautia sp. KLE 17320.505%0.152% – 1.41%Dans l’intervalle
Clostridium sp. KLE 17550.00735%0.00708% – 0.0999%Dans l’intervalle Comparaison moins certaine
Ruminococcus sp. CAG:3300%0% – 0.0182%Dans l’intervalle
Firmicutes bacterium CAG:7910.00221%0.00042% – 0.00355%Dans l’intervalle
Firmicutes bacterium CAG:410.174%0.0152% – 0.35%Dans l’intervalle
Butyrivibrio sp. AD30020.0022%0.000431% – 0.00466%Dans l’intervalle
Intestinimonas butyriciproducens0.02%0.0121% – 0.107%Dans l’intervalle
Atopobium minutum0.001%0% – 0.00194%Dans l’intervalle
Lachnospiraceae bacterium AC20120.00255%0.00041% – 0.0027%Dans l’intervalle Comparaison moins certaine
Eisenbergiella tayi0.0113%0.00189% – 0.0804%Dans l’intervalle
Hungatella hathewayi0.478%0.023% – 0.123%Au-dessus de l’intervalle
Ruthenibacterium lactatiformans0.135%0.0503% – 0.605%Dans l’intervalle
Corynebacterium imitans0%0% – 0.000848%Dans l’intervalle
Akkermansia glycaniphila0.003%0% – 0.000724%Au-dessus de l’intervalle
Actinomyces sp. HMSC065F110%0% – 0.000848%Dans l’intervalle Comparaison moins certaine
Butyricicoccus sp. K4410.MGS-460.187%0.0161% – 0.159%Au-dessus de l’intervalle
Ndongobacter massiliensis0%0% – 0.00121%Dans l’intervalle
Mobiluncus curtisii0.00177%0.000496% – 0.00362%Dans l’intervalle
Catabacter hongkongensis0.00146%0.000268% – 0.00495%Dans l’intervalle
Peptococcus niger0%0% – 0.00199%Dans l’intervalle
Peptoniphilus indolicus0%0% – 0.000835%Dans l’intervalle
[Ruminococcus] torques0.0471%0.0151% – 0.497%Dans l’intervalle
[Clostridium] asparagiforme0.0495%0.00733% – 0.0591%Dans l’intervalle
Eubacterium ramulus0.26%0.0593% – 0.45%Dans l’intervalle
Coprococcus comes0.133%0.0882% – 0.577%Dans l’intervalle
Rothia mucilaginosa0.00172%0.0000755% – 0.00434%Dans l’intervalle
Corynebacterium urealyticum0%0% – 0.00104%Dans l’intervalle
Corynebacterium massiliense0%0% – 0.000735%Dans l’intervalle
Brevibacterium ravenspurgense0%0% – 0.000487%Dans l’intervalle
Olsenella umbonata0%0% – 0.0000184%Dans l’intervalle Comparaison moins certaine
Leptotrichia sp. oral taxon 2120%0% – 0.0000834%Dans l’intervalle Comparaison moins certaine
Haemophilus parainfluenzae0.000611%0.0001% – 0.0575%Dans l’intervalle
Aggregatibacter aphrophilus0%0% – 0.000438%Dans l’intervalle
Gemella sanguinis0%0% – 0.00147%Dans l’intervalle
Dorea longicatena0.285%0.0855% – 1.07%Dans l’intervalle
Mageeibacillus indolicus0.000529%0% – 0.00137%Dans l’intervalle
Faecalibacterium prausnitzii0.0816%0.163% – 1.64%En dessous de l’intervalle
Roseburia intestinalis2.79%0.123% – 2.32%Au-dessus de l’intervalle
Roseburia inulinivorans0.945%0.165% – 1.72%Dans l’intervalle
Roseburia hominis0.499%0.0985% – 0.9%Dans l’intervalle
Akkermansia muciniphila0.59%0.000993% – 1.18%Dans l’intervalle
Bifidobacterium longum0.429%0.00095% – 0.857%Dans l’intervalle
Bifidobacterium adolescentis0.561%0.000242% – 1.12%Dans l’intervalle
Processus génétiques 7
MesureMesuréIntervalle de référenceComparaison
GLUCUROCAT-PWY: superpathway of β-D-glucuronide and D-glucuronate degradation0.0106%0.0039% – 0.0132%Dans l’intervalle
PWY-5177: glutaryl-CoA degradation0.00474%0.00156% – 0.00792%Dans l’intervalle
GLUDEG-I-PWY: GABA shunt0.00218%0% – 0.00436%Dans l’intervalle
TRPSYN-PWY: L-tryptophan biosynthesis0.00991%0.00329% – 0.0165%Dans l’intervalle
PWY-5676: acetyl-CoA fermentation to butanoate II0.00189%0% – 0.00378%Dans l’intervalle
PWY-5022: 4-aminobutanoate degradation V0.0012%0% – 0.0024%Dans l’intervalle
PWY-5100: pyruvate fermentation to acetate and lactate II0.00977%0.00428% – 0.0153%Dans l’intervalle

Méthodes, en bref

  • Un laboratoire séquence l’échantillon. Le prototype lit le tableau de mesures traité ; il ne séquence pas lui-même les échantillons.
  • Chaque mesure est comparée au 10e et au 90e centile d’un groupe de comparaison issu d’une étude, modélisés pour l’âge, le sexe et l’IMC enregistrés.
  • Une seule version figée du modèle est utilisée, pour qu’un rapport ultérieur puisse être comparé à la même référence.
  • Les comparaisons décrivent où se situe un résultat par rapport à un groupe d’étude. La validation clinique est la prochaine étape de la recherche.

LE PROCHAIN CHAPITRE COMMENCE PAR UNE QUESTION.

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