PER PAZIENTI E FAMIGLIE · ESEMPIO

Come potrebbe
apparire un referto.

Un esempio costruito da un campione inventato e passato per lo stesso calcolo che usa il prototipo. Nulla qui è il risultato di una persona reale.

In sviluppo · Studio pilota in preparazione

Tre parole da conoscere prima

Misurato
La quota di un tipo di batterio o di un processo genetico nel campione, in percentuale di tutto ciò che è stato riportato. Una quota di tutto ciò che è stato riportato.
Intervallo di riferimento
Dove si collocava la maggior parte delle persone di un gruppo di confronto di uno studio, aggiustato per età, sesso e indice di massa corporea. Un confronto che dà contesto al suo risultato.
Confronto
Se la quota misurata si collocava sotto, dentro o sopra quell’intervallo. Il punto di partenza della conversazione con il suo clinico.
REFERTO DI ESEMPIO · DATI INVENTATI
Campione
Profilo completo illustrativo
Contesto registrato
Donna, 46 anni, IMC 24,5 (inventato)
Revisionato da
Clinico di esempio
Analisi
Modello di riferimento fisso, versione 1
  • 48Nell’intervallo
  • 5Sopra l’intervallo
  • 1Sotto l’intervallo

Sintesi del suo clinico

Tutte le 54 misurazioni sono state confrontate con l’intervallo di riferimento: 48 si trovavano al suo interno, 5 sopra e 1 sotto. Ogni confronto è un punto di partenza per la nostra conversazione. Qui sotto le sei di cui vorrei parlare con lei, con ciò che la ricerca mostra per ciascuna.

Risultati da discutere

Sei confronti si collocavano fuori dall’intervallo. Per ciascuno: la quota misurata, l’intervallo e ciò che questo ci dice.

Tipo di batterio

Oscillibacter sp. KLE 1745

Sopra l’intervallo
Misurato1.21%
Intervallo di riferimento0.071% – 0.671%

Che cosa significa

Questo particolare tipo di Oscillibacter costituiva una quota del campione maggiore rispetto alla maggior parte del gruppo di confronto.

Tipo di batterio

Hungatella hathewayi

Sopra l’intervallo
Misurato0.478%
Intervallo di riferimento0.023% – 0.123%

Che cosa significa

Una quota maggiore rispetto alla maggior parte del gruppo di confronto. Questa specie compare in ricerche su dieta e intestino condotte in altri gruppi di persone.

Tipo di batterio

Akkermansia glycaniphila

Sopra l’intervallo
Misurato0.003%
Intervallo di riferimento0% – 0.000724%

Che cosa significa

Rilevata a una quota molto piccola, dove nella maggior parte del gruppo di confronto non era rilevata affatto.

Tipo di batterio

Butyricicoccus sp. K4410.MGS-46

Sopra l’intervallo
Misurato0.187%
Intervallo di riferimento0.0161% – 0.159%

Che cosa significa

Leggermente sopra l’intervallo, vicino al suo limite superiore.

Tipo di batterio

Faecalibacterium prausnitzii

Sotto l’intervallo
Misurato0.0816%
Intervallo di riferimento0.163% – 1.64%

Che cosa significa

Una quota minore rispetto alla maggior parte del gruppo di confronto. È un batterio intestinale molto studiato, spesso citato insieme al butirrato e al sistema immunitario.

Tipo di batterio

Roseburia intestinalis

Sopra l’intervallo
Misurato2.79%
Intervallo di riferimento0.123% – 2.32%

Che cosa significa

Una quota maggiore rispetto alla maggior parte del gruppo di confronto. Questa specie è studiata per la produzione di butirrato, un acido grasso a catena corta.

Prossimi passi

Parleremo di questi sei confronti al suo appuntamento, e decideremo insieme se qualcuno merita uno sguardo più attento.

Controllo nel tempo

Un campione successivo potrebbe essere confrontato con questo per vedere che cosa è cambiato, senza presumerne il perché.

Tutte le 54 misurazioni

Ogni misurazione che il referto ha confrontato, raggruppata per tipo. I valori sono quote di ciò che è stato riportato, arrotondate.

Tipi di batteri 47
MisurazioneMisuratoIntervallo di riferimentoConfronto
Atopobium sp. BV3Ac40%0% – 0.00024%Nell’intervallo
Coriobacteriaceae bacterium BV3Ac10.000208%0% – 0.000994%Nell’intervallo
Fusicatenibacter saccharivorans0.393%0.181% – 1.38%Nell’intervallo
Oscillibacter sp. KLE 17451.21%0.071% – 0.671%Sopra l’intervallo
Blautia sp. KLE 17320.505%0.152% – 1.41%Nell’intervallo
Clostridium sp. KLE 17550.00735%0.00708% – 0.0999%Nell’intervallo Confronto meno certo
Ruminococcus sp. CAG:3300%0% – 0.0182%Nell’intervallo
Firmicutes bacterium CAG:7910.00221%0.00042% – 0.00355%Nell’intervallo
Firmicutes bacterium CAG:410.174%0.0152% – 0.35%Nell’intervallo
Butyrivibrio sp. AD30020.0022%0.000431% – 0.00466%Nell’intervallo
Intestinimonas butyriciproducens0.02%0.0121% – 0.107%Nell’intervallo
Atopobium minutum0.001%0% – 0.00194%Nell’intervallo
Lachnospiraceae bacterium AC20120.00255%0.00041% – 0.0027%Nell’intervallo Confronto meno certo
Eisenbergiella tayi0.0113%0.00189% – 0.0804%Nell’intervallo
Hungatella hathewayi0.478%0.023% – 0.123%Sopra l’intervallo
Ruthenibacterium lactatiformans0.135%0.0503% – 0.605%Nell’intervallo
Corynebacterium imitans0%0% – 0.000848%Nell’intervallo
Akkermansia glycaniphila0.003%0% – 0.000724%Sopra l’intervallo
Actinomyces sp. HMSC065F110%0% – 0.000848%Nell’intervallo Confronto meno certo
Butyricicoccus sp. K4410.MGS-460.187%0.0161% – 0.159%Sopra l’intervallo
Ndongobacter massiliensis0%0% – 0.00121%Nell’intervallo
Mobiluncus curtisii0.00177%0.000496% – 0.00362%Nell’intervallo
Catabacter hongkongensis0.00146%0.000268% – 0.00495%Nell’intervallo
Peptococcus niger0%0% – 0.00199%Nell’intervallo
Peptoniphilus indolicus0%0% – 0.000835%Nell’intervallo
[Ruminococcus] torques0.0471%0.0151% – 0.497%Nell’intervallo
[Clostridium] asparagiforme0.0495%0.00733% – 0.0591%Nell’intervallo
Eubacterium ramulus0.26%0.0593% – 0.45%Nell’intervallo
Coprococcus comes0.133%0.0882% – 0.577%Nell’intervallo
Rothia mucilaginosa0.00172%0.0000755% – 0.00434%Nell’intervallo
Corynebacterium urealyticum0%0% – 0.00104%Nell’intervallo
Corynebacterium massiliense0%0% – 0.000735%Nell’intervallo
Brevibacterium ravenspurgense0%0% – 0.000487%Nell’intervallo
Olsenella umbonata0%0% – 0.0000184%Nell’intervallo Confronto meno certo
Leptotrichia sp. oral taxon 2120%0% – 0.0000834%Nell’intervallo Confronto meno certo
Haemophilus parainfluenzae0.000611%0.0001% – 0.0575%Nell’intervallo
Aggregatibacter aphrophilus0%0% – 0.000438%Nell’intervallo
Gemella sanguinis0%0% – 0.00147%Nell’intervallo
Dorea longicatena0.285%0.0855% – 1.07%Nell’intervallo
Mageeibacillus indolicus0.000529%0% – 0.00137%Nell’intervallo
Faecalibacterium prausnitzii0.0816%0.163% – 1.64%Sotto l’intervallo
Roseburia intestinalis2.79%0.123% – 2.32%Sopra l’intervallo
Roseburia inulinivorans0.945%0.165% – 1.72%Nell’intervallo
Roseburia hominis0.499%0.0985% – 0.9%Nell’intervallo
Akkermansia muciniphila0.59%0.000993% – 1.18%Nell’intervallo
Bifidobacterium longum0.429%0.00095% – 0.857%Nell’intervallo
Bifidobacterium adolescentis0.561%0.000242% – 1.12%Nell’intervallo
Processi genetici 7
MisurazioneMisuratoIntervallo di riferimentoConfronto
GLUCUROCAT-PWY: superpathway of β-D-glucuronide and D-glucuronate degradation0.0106%0.0039% – 0.0132%Nell’intervallo
PWY-5177: glutaryl-CoA degradation0.00474%0.00156% – 0.00792%Nell’intervallo
GLUDEG-I-PWY: GABA shunt0.00218%0% – 0.00436%Nell’intervallo
TRPSYN-PWY: L-tryptophan biosynthesis0.00991%0.00329% – 0.0165%Nell’intervallo
PWY-5676: acetyl-CoA fermentation to butanoate II0.00189%0% – 0.00378%Nell’intervallo
PWY-5022: 4-aminobutanoate degradation V0.0012%0% – 0.0024%Nell’intervallo
PWY-5100: pyruvate fermentation to acetate and lactate II0.00977%0.00428% – 0.0153%Nell’intervallo

Metodi, in breve

  • Un laboratorio sequenzia il campione. Il prototipo legge la tabella di misurazioni elaborata; non sequenzia i campioni.
  • Ogni misurazione è confrontata con il 10º e il 90º percentile di un gruppo di confronto di uno studio, modellati per età, sesso e IMC registrati.
  • Si usa una sola versione fissa del modello, così un referto successivo può essere confrontato con lo stesso riferimento.
  • I confronti descrivono dove si colloca un risultato rispetto a un gruppo di studio. La validazione clinica è la prossima tappa della ricerca.

IL PROSSIMO CAPITOLO INIZIA CON UNA DOMANDA.

Capire di più.
Insieme.

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